워라밸 중독자

> str(metcyc_list)List of 6 $ S10:'data.frame': 411 obs. of 12 variables: ..$ A1 : num [1:411] 346 65.7 26.9 173.9 384.5 ... ..$ A2 : num [1:411] 307.5 75.3 33.7 173.5 367.8 ... ..$ A3 : num [1:411] 325.5 77.9 23.4 196.9 373.8 ... ..$ A3055: num [1:411] 318.2 75.7 15.8 147.6 360.4 ... ..$ A3151: num [1:411] 327.1 67.5 22.6 170.3 336.2 ... ..$ A3204: num [1:411] 319.6 104.2 71.2 213 ..

Step 1R에서 pdf로 출력한 파이차트를 잉크스케이프로 불러온다파이차트는 여러개의 경로로 이루어져 있다.전부 선택한 뒤 [객체] -> [패턴] -> [ 객체 -> 패턴]이렇게하면 여러개로 나눠졌던 경로가 하나의 패턴이 된다.Step 2흰색 원을 그린 뒤 가운데 정렬한다.흰색 원이 맨 위에 있어야한다.Step 3[경로] 탭에 있는 메뉴들은 2개의 경로에 대해서만 작동 가능하다.패턴은 경로에 포함되는 것 같다.두 경로 (파이차트와 흰색 원) 를 선택한 뒤 [Ctrl + -] (제외)

R constructs [David Zelený] davidzeleny.net

원을 다 세모로 바꾸려 한다1. 세모를 Ctrl + D 로 원 개수만큼 복제2. 원과 세모 전부 선택 (둘 중 한 가지 도형을 먼저 다 선택해야함)3. [정렬 및 분산하기] 탭의 [재배열하기] 에서 [선택된 객체의 위치 교환하기 - 선택항목 순서입니다.] 를 도형이 다 바뀔때 까지 클릭!! 너모 쉽죵?

https://rbasall.tistory.com/224 R 업데이트, R스튜디오 업데이트, 패키지 업데이트, 패키지 옮기기1. R 업데이트 install.packages("installr") library(installr) updateR() 2. R 스튜디오 업데이트 껐다 키면 됨. 3. R 버전 확인 version() 4. 라이브러리 옮기기 이전 버전에 있는 폴더들을 복붙하여 새버전폴더 안으rbasall.tistory.comhttps://jaydata.tistory.com/104 [R] .libPaths()를 이용한 "package or namespace load failed" 조치Table of Contents Introduction 패키지 설치 경로 탐색 함수, .libPaths() Referen..

> dat3# A tibble: 33 × 17 parent node branch.length label isTip x y branch angle Taxon Status Subtree Cluster Source Long taxonomy 1 473 1 0.242 ASV_8678 TRUE 0.248 1 0.127 0.764 Monot… Outli… 10 10.Mon… query no Fungi;A… 2 473 2 0.545 ASV_9394 TRUE 0.551 2 0.279 1.53 ..

> des_df %>% filter(Source == "DB")# A tibble: 5 × 16 parent node branch.length label isTip x y branch angle Taxon Status Subtree Cluster Source Long taxonomy 1 542 29 0.000001 NR_111570_1 TRUE 0.683 163 0.683 119. 7 Non-M… 108 108.7 DB no Fungi;M…2 546 33 0.00453 NR_111571_1 TR..

> TreeCluster_stats %>% head() Taxa Tips Category Subtree1 33 354 Total 02 29 82 Monophyletic 03 4 272 Non-Monophyletic 04 Monotypic 05 0 0 Intruder 06 4 248 Outlier 01. 열 이름 (변수명)으로  바꾸기> TreeCluster_stats % select(Subtree, Category, Taxa, Tips)> TreeCluster_stats %>% head() Subtree ..

Phylogenetic tree data인데 label에 TMF나 ASV가 있으면 Source 열에 "query" 를 집어넣고 싶음> dat# A tibble: 937 × 13 parent node branch.length label isTip x y branch angle Taxon Subtree Cluster Source 1 451 1 0 NR_119548_1 TRUE 0 1 0 0.8 NA NA NA..

tidyr package의 pivot_wider(), pivot_longer() 을 와리가리해보자Dataset은 아래와 같다> ref_tax# A tibble: 33,493 × 8 label Class Family Genus Kingdom Order Phylum Species 1 NR_073208_1 Tremellomycetes Trichosporonaceae Apiotrichum Fungi Trichos..